The Good Doctor gira em torno de Shaun Murphy (Freddie Highmore), um jovem cirurgião residente que sofre de autismo e síndrome de Savant, também conhecida como "síndrome do sábio", uma doença que lhe causa problemas à hora de se relacionar com os outros. Mas também lhe permitu desenvolver aptidões mentais prodigiosas, como a sua memória extraordinária.
Embora Shaun tenha tido uma infância muito difícil, tornou-se num médico muito talentoso e foi recrutado pelo Dr. Aaron Glassman (Richard Schiffy) para a unidade de cirurgia pediátrica do prestigiado Hospital San José St. Bonaventure. No entanto, nem toda a direção do hospital concorda com a decisão de trazer um cirurgião com autismo para a equipa. Shaun não demora muito a demonstrar o seu valor, mas embora ele possa ter encontrado o seu caminho na sala de cirurgia, ainda há muitos desafios e preconceitos que deve enfrentar para concretizar o seu sonho de salvar vidas.
